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首页-红旗娱乐-「再一次,改变生活」

2023-01-11 10:09:14 yqs888 7

首页-红旗娱乐-「再一次,改变生活」报道,最近发表在《Scientific Reports》杂志上的一项研究检查了SARS-CoV-2全基因组数据,以确定与病毒传播增加相关的刺突蛋白区域周围的缺失突变,并确定了易缺失的刺突蛋白区域表明免疫逃逸的进化策略。

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背景


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尽管新型冠状病毒 (COVID-19) 疫苗成功地减缓了SARS-CoV-2感染在全球范围内的快速传播和严重程度,但突破性感染数量的增加表明新出现的SARS-CoV-2变体逃避免疫的能力越来越强疫苗接种和先前感染引起的反应。

使用来自新型冠状病毒感染患者的中和抗体进行的研究已将刺突蛋白的受体结合域 (RBD) 和 N末端域 (NTD) 确定为中和抗体的主要靶标。NTD是许多中和抗体靶向的抗原超位点,也被发现携带缺失,其中四个区域具有反复缺失。由于研究表明此类缺失突变会降低针对NTD的中和抗体的中和功效,因此有必要了解这些缺失在提高SARS-CoV-2的传播能力方面也可能发挥的作用。


关于研究

在本研究中,研究人员使用了来自世界各地的全球禽流感数据共享倡议 (GISAID) 数据库中存储的全基因组序列,总共约230万条,以及SARS-CoV-2全基因组序列由102名突破性SARS-CoV-2感染患者产生。由SARS-CoV-2阳性率组成的流行病学数据是从我们的数据世界 (OWID) 和其他数据库中获取的。

在三个月的时间间隔内评估每月的突变流行率和SARS-CoV-2检测阳性率,以确定与新型冠状病毒感染病例突然增加相关的突变。显示流行率单调增加对应于SARS-CoV-2阳性测试单调增加的突变被认为是激增相关突变。

然后将确定为与新型冠状病毒感染病例激增相关的突变与美国 (US) 疾病控制和预防中心 (CDC) 确定的四种关注变体和七种感兴趣变体的突变进行比较。关注的变体包括Alpha、Beta、Delta和Gamma变体,而关注的变体包括Epsilon、Eta、Iota、Kappa和Zeta子变体。

此外,还评估了各种突变类型,例如插入、删除和替换,以确定它们在激增相关突变中的富集情况。还鉴定了刺突蛋白NTD中的反复缺失位点。研究人员还构建了一个时间序列图块来检查具有反复删除的区域的时间扩展。